HiWi - Systemadministration für medizinische Studie
Hiwitätigkeit
Im Rahmen des Projekts Genomic Data Science

Description

Das Institut für Informationsverarbeitung (TNT) ist seit mehreren Jahren Teil des Forschungsverbunds P4D, einem interdisziplinären Projekt zur Verbesserung der Früherkennung, Diagnostik, Therapie und Prävention depressiver Erkrankungen durch moderne, datengestützte Medizin.

Im Rahmen der Studie betreibt unser Institut eine leistungsfähige IT-Infrastruktur mit einem verteilten Rechencluster, mehreren Webdiensten sowie einem Storage-System im Petabyte-Bereich. Diese Plattform dient der Sammlung, Verwaltung und Analyse der im Projekt erhobenen Studiendaten.

Zur Unterstützung bei der Administration der Server suchen wir aktuell eine studentische Hilfskraft (HiWi, m/w/d).

Deine Aufgaben:

  • Unterstützung bei der Wartung und Ausführung von Bioinformatik-Pipelines (z. B. Nextflow) in einer SLURM-Umgebung
  • Betreuung und technische Wartung von Webplattformen zur internen Datennutzung
  • Mitarbeit im Betrieb und Monitoring eines Petabyte-Storage-Systems
  • Unterstützung bei Systemupdates, Nutzerverwaltung und der Automatisierung wiederkehrender Aufgaben

Requirements

  • Zwingend erforderlich: Gute Kenntnisse in Linux-Systemadministration, Bash und Python
  • Von Vorteil (aber nicht zwingend): Erfahrung mit HPC-Clustern, Batchsystemen (z. B. SLURM), Docker/Singularity oder Grundlagen der bioinformatischen Datenverarbeitung

Contact person: Fabian Müntefering